Co to jest COVID-19? Siedem kluczowych punktów do zrozumienia SARS-CoV-2 i przeprowadzanych testów

Opublikowano na 06/11/2020 by Lech Biegalski


Dr Pascal Sacré jest lekarzem specjalizującym się w opiece krytycznej, autorem i znanym analitykiem zdrowia publicznego.

Dr Pascal Sacré
Global Research, November 01, 2020
(Tłum.: L.B.)

(Jest to drugi z serii trzech artykułów dr Pascala Sacré, który tłumaczę na język polski dla czytelników Regionu Pojezierze. Trzeci pojawi się najprawdopodobniej w sobotę. – L.B.)

Wprowadzenie

COVID-19 pojawił się w Europie i obu Amerykach w 2020 roku, po pojawieniu się nowego wirusa z Chin w 2019 roku.

Ten nowy wirus należy do dobrze znanej rodziny koronawirusów, która wywołała już dwie szczególnie poważne epidemie w 2003 i 2012 roku.

Ten nowy wirus nazywa się SARS-CoV-2, trzeci koronawirus odpowiedzialny za zespół ciężkiej niewydolności oddechowej.

Ciężkość tego zespołu charakteryzuje się głównie hipoksemią, brakiem tlenu we krwi.

Stwierdziliśmy, że to ciężkie zajęcie płuc obserwuje się u stosunkowo niewielkiej liczby pacjentów zakażonych SARS-CoV-2, z których większość nie ma objawów lub ma tylko chorobę grypopodobną lub nawet przeziębienie.

W przypadku pacjentów najbardziej dotkniętych chorobą, głównie osób starszych i / lub osób osłabionych przez jedną lub więcej chorób przewlekłych (niewydolność serca, układu oddechowego i nerek, cukrzyca, wysokie ciśnienie krwi, otyłość itp.), śmiertelność byłaby nieco wyższa niż w przypadku grypy sezonowej dokładne dane nadal wymagają oceny.

Te liczby są dziś nadal kontrowersyjne, a niektórzy naukowcy i lekarze argumentują, popierając to dowodami, że śmiertelność została przeszacowana przez oficjalne ośrodki zdrowia.

Uważałem, że ważne jest wyjaśnienie kilku punktów w odniesieniu do tego koronawirusa SARS-CoV-2 z chorobą COVID-19, z jego diagnozą kliniczną i radiologiczną, a zwłaszcza z techniką RT-PCR używaną jako główne narzędzie przesiewowe.

Kończę kilkoma słowami na temat sposobu przenoszenia wirusa przez aerozole i cząsteczki unoszące się w powietrzu, wskazując w szczególności na znaczenie właściwej wentylacji zamkniętych przestrzeni.

1. Rozmiar wirusa

1 milimetr (mm) = 1000 mikrometrów lub mikronów (μm) = 1000000 nanometrów (nm)

Średnica ludzkiego włosa:   150 mikrometrów (μm)

Rozmiar koronawirusa SARS-CoV-2:   0,125 μm (125 nm), 1/1200 włosa

Wirus grypy (Influenzavirus) rozmiar:   0,08-0,120 μm (80-120 nm)

2. Koronawirus i COVID-19

Koronawirus lub CoV = wirus RNA (kwas rybonukleinowy)

DNA i RNA

DNA to kwas dezoksyrybonukleinowy

Kwas dezoksyrybonukleinowy lub DNA to biologiczna cząsteczka obecna we wszystkich komórkach, a także w wielu wirusach. DNA zawiera całą informację genetyczną, zwaną genomem, która umożliwia rozwój, funkcjonowanie i reprodukcję żywych istot.

Genom składa się z genów złożonych z DNA lub RNA.

Symbolizujmy podwójną helisę DNA drabiną:

DNA składa się z dwóch nici RNA. RNA składa się z jednej z dwóch nici DNA.

Wszystkie komórki zawierają DNA lub RNA, nawet wirusy, które nie są komórkami, ale cząstkami, materiałem genetycznym (DNA lub RNA) otoczonym kapsułką lub nukleokapsydem.

O takich cząstkach nie można powiedzieć, że są „żywe”, są to pakiety informacji zgromadzonych na genetycznym nośniku (geny tworzące genom).

Cząsteczki wirusa wykorzystują komórki, które infekują do replikacji (reprodukcji) swojego genomu (DNA lub RNA) i do namnażania.

W ten sposób zabijają komórkę, na której pasożytują i wywołują reakcję obronną atakowanego organizmu.

Koronawirusy CoV to wirusy RNA, takie jak Ebola, Zika, odra, grypa.

CoV to największe wirusy RNA.

Wirus opryszczki (ospa wietrzna) jest wirusem DNA.

Wirusy koronowe lub CoV

Tworzą ogromną rodzinę wirusów.

Ich genom (RNA) jest bardzo długi: kilka tysięcy (30 000) nukleotydów lub zasad tworzących jednoniciowy liniowy RNA kodujący od 7 do 10 białek.

Są otoczone kapsułką białkową w kształcie korony.

Ludzie mogą być zarażeni 5 głównymi typami koronawirusa:

  • HCoV-229E oraz HCoV-OC43 powodujące przeziębienia i łagodne objawy grypopodobne.
  • SARS-CoV-1 odpowiedzialny od listopada 2002 r. do lipca 2003 r. za epidemię ciężkiego ostrego zespołu oddechowego (SARS).
  • MERS-CoV odpowiedzialna za epidemię ciężkiego zespołu oddechowego w 2012 roku, głównie na Półwyspie Arabskim (począwszy od Arabii Saudyjskiej), ale także w Korei Południowej. MERS to Bliskowschodni Syndrom Oddechowy.
  • SARS-CoV-2, bardzo podobny do SARS-CoV-1, odpowiedzialny za epidemię ciężkiego zespołu oddechowego, który przekształcił się w pandemię. Począwszy od 2019 roku. Choroba wywoływana przez SARS-CoV-2 to COVID-19 (nazwa choroby bierze się z: COrona VIrus Disease, która pojawiła się w 2019 roku).

Pamiętajmy więc, że koronawirusy u ludzi są powszechne i odpowiadają za 30% corocznych przeziębień, podobnie jak inne wirusy, zwłaszcza rinowirusy.

Pamiętajmy również, że koronawirusy, podobnie jak wiele wirusów, mają ważną zdolność do ewolucji i adaptacji (mutacji), co może prowadzić do pojawienia się wariantów i mniej lub bardziej patogennych wirusów.

3. SARS-CoV-1: Severe acute respiratory syndrome CoV-1

(Zespół ciężkiej ostrej niewydolności oddechowej-CoV-1)

Pierwszy znany koronawirus wywołujący poważną chorobę u ludzi.

Epidemia między listopadem 2002 a lipcem 2003.

Ponad 8 000 przypadków w 30 krajach (20% przypadków wśród pracowników służby zdrowia).

774 zgonów lub około 10% śmiertelności.

Umiarkowana zdolność przenoszenia (zaraźliwość).

Wyjątkowa zdolność do mutacji i rekombinacji.

Pełne sekwencjonowanie genomu SARS-CoV-1 wykonane przez amerykańskie i kanadyjskie zespoły badawcze.

4. MERS-CoV: Middle-East Respiratory Syndrome-CoV

(Bliskowschodni zespół oddechowy-CoV)

Drugi koronawirus, o którym wiadomo, że spowodował ciężką chorobę u ludzi.

Pierwsze przypadki w 2012 roku w Arabii Saudyjskiej.

Ponad 1500 przypadków w 26 krajach, głównie na Półwyspie Arabskim i Korei Południowej.

Ponad 550 zgonów, bardzo wysoka śmiertelność wynosząca 30%.

5. SARS-CoV-2: Severe acute respiratory syndrome CoV-2

(Zespół ciężkiej ostrej niewydolności oddechowej-CoV-2)

Trzeci koronawirus, o którym wiadomo, że spowodował poważną chorobę u ludzi, chorobę zwaną COVID-19 (nazwa od: COrona VIrus Disease, która pojawiła się w 2019 r.)

Aktualna zachorowalność i śmiertelność na Covid-19 (według oficjalnych danych) jest na bieżąco aktualizowana tutaj:

Uważa się, że SARS-CoV-2 pojawił się w Chinach późną wiosną / wczesnym latem 2019 r., a w Europie w październiku 2019 r.

Linki:

Jego sekwencjonowanie genetyczne jest aktualizowane (po częstych mutacjach) na stronie:

Jest również ściśle monitorowany przez laboratorium zespołu profesora Didiera Raoulta w Marsylii w IHU-Méditerranée.

6. Szczepionka

Jak dotąd NIE MA szczepionki przeciwko SARS-CoV (2003) lub MERS-CoV (2012)!

Jednak w przypadku COVID-19 cały świat czeka na szczepionkę, licząc na jedną szczepionkę – jeśli to możliwe – w ciągu kilku miesięcy!

W latach 1999-2017, 11 największych laboratoriów farmaceutycznych na świecie osiągnęło 1019 miliardów euro zysków. Z tego 925 miliardów euro (90,7%) zostało rozdzielonych między ich udziałowców.

Tutaj branża szczepionek, która jest relatywnie skromna (3% światowej sprzedaży w 2009 roku), wraz z rozwojem biotechnologii, prezentuje się jako najbardziej dynamiczna nisza (wzrost o 24% w latach 2011-2014).

W tej gałęzi przemysłu farmaceutycznego dominują cztery grupy (Merck, Sanofi, GSK i Pfizer), które odpowiadają za 65% sprzedaży.

Grupy z krajów rozwijających się umacniają się na pozostałych rynkach zbytu: Serum Institute and Biological E (Indie), Butatan Institute i Bio-Manguinos (Brazylia), CNBG (Chiny)… Dzisiaj wydaje się, że specjaliści [którzy poparli oficjalną narrację] jednomyślnie potwierdzają, że głównym wyzwaniem jest opracowanie szczepionki przeciwko Covid-19.

7. Obraz kliniczny

A. Okres inkubacji (czas między zakażeniem a wystąpieniem objawów):

  • SARS-CoV-1 i SARS-CoV-2: od 2 do 7 dni
  • MERS-CoV: od 5 do 15 dni

To właśnie pierwszego dnia objawów osobnik jest najbardziej zakaźny (najwyższe obciążenie wirusowe i duża zdolność do przenoszenia go przez kaszel). Chory w tym czasie musi być odizolowany!

W ostrej fazie epidemii (marzec-kwiecień 2020) odnotowano wydalanie 700 000 kopii wirusowego RNA / μl w pierwszym dniu objawów, a po kilku dniach wydalanie około 700 000 000 kopii wirusowego RNA / μl !

B. Diagnoza jest przede wszystkim kliniczna (objawy):

a. Główne objawy:

  • Kaszel
  • Duszność (trudności w oddychaniu) z desaturacją tlenu we krwi (O2)
  • Ból w klatce piersiowej
  • Anosmia (utrata węchu)
  • Zaburzenia smaku bez innej widocznej przyczyny

b. Drobne objawy:

  • Gorączka
  • Zmęczenie
  • Nieżyt nosa lub przeziębienie (katar)
  • Ból gardła (dławica piersiowa)
  • Ból głowy (ból głowy)
  • Anoreksja (utrata apetytu) – odchudzanie
  • Wodnista biegunka (płynny stolec) bez innej widocznej przyczyny
  • Ostre splątanie (zaburzenie orientacji)
  • Nagłe upadki bez innej widocznej przyczyny

Zwróć uwagę, że utrata węchu i smaku może wynikać z niedoboru cynku, pierwiastka śladowego, który odgrywa ważną rolę w naszych mechanizmach obronnych!

Oznaki wskazujące na niedobór cynku:

  • Zaburzenia smaku. Cynk wpływa na syntezę gustinu, białka niezbędnego do postrzegania smaku w kubkach smakowych.
  • Brak węchu, zaburzenia węchu.

Te objawy były, według niektórych badań, pierwszymi oznakami zakażenia koronawirusem. Dlatego jest wysoce prawdopodobne, że nadmierne pobudzenie układu odpornościowego prowadzi do wzrostu niedoboru cynku, powodując te objawy u niektórych osób.

Linki:

Wynik kliniczny:

Jeśli wynik jest > / = 2, podejrzewa się COVID-19. Możesz to potwierdzić szybko i te objawy nie są specyficzne!

Strategia kategoryzowania stopnia ciężkości stanu i najlepszego prowadzenia każdej osoby w zależności od jej stanu i / lub możliwej ewolucji.

Wynik EWS (wczesnych sygnałów ostrzegawczych):

  • Ciężka postać – (przyjęcie na intensywną terapię z ryzykiem śmierci)
  • COVID-19 dotyka osoby osłabione, z obniżoną odpornością i / lub cierpiące na poważne chroniczne schorzenia, takie jak cukrzyca, niewydolność nerek, przewlekła choroba płuc, choroby serca, otyłość.

Poważne czynniki ryzyka:

  • BMI = wskaźnik masy ciała = masa podzielona przez wzrost2 , przykład: waga 100 kg wzrost 1,70 m => BMI = 100 / 1,72 = 34 = ciężka otyłość.

C. Skan CT klatki piersiowej

Ten test zapewnia obrazowanie płuc w celu potwierdzenia rozpoznania COVID-19, na przykład w przypadku ujemnego wyniku RT-PCR pomimo pozytywnego obrazu klinicznego (wynik kliniczny >/= 2).

Normalny skan CT płuc:

Abnormalny scan CT płuc:

OSTRZEŻENIE, te ilustracje nie są specyficzne dla COVID-19!

Reprezentują grupę patologii płuc określanych ogólną nazwą ARDS (zespół ostrej niewydolności oddechowej).

https://fr.wikipedia.org/wiki/Syndrome_de_d%C3%A9tresse_respiratoire_aigu%C3%AB#:~:text=The ARDS% 20Definition% 20task% 20force, des% 20notions% 20d’acute% 20lung

ARDS może być spowodowany wieloma przyczynami, wewnątrz- lub pozapłucnymi, zakaźnymi lub niezakaźnymi.

Przyczyny śródpłucne:

  • Bakteryjne, wirusowe zapalenie płuc (grypa, syncitial Virus lub RSV, SARS)
  • Chemiczna pneumopatia (wdychanie płynu trawiennego) lub wdychanie dymu
  • Uraz klatki piersiowej

Przyczyny pozapłucne:

  • Zapalenie trzustki (uogólnione zapalenie trzustki z martwicą)
  • Zakażenia pozapłucne z ciężką posocznicą (zakażeniem) i / lub wstrząsem septycznym
  • Rozległe oparzenia
  • Wstrząs kardiogenny (niewydolność serca dowolnego pochodzenia)

itp.

Tak więc, jak widać, zmiany wyglądające jak zamarznięta, matowa szyba są typowe dla ARDS, a nie dla jakiejś szczególnej przyczyny.

Występują one w szczególności w zakaźnym zapaleniu płuc z tak zwanymi atypowymi zarazkami, takimi jak Mycoplasma Pneumoniae, Chlamydia Pneumoniae czy Legionella Pneumophila, ale także w niezakaźnych pneumopatiach.

Zawsze należy stosować diagnozę różnicową, zwłaszcza u osób z jednym lub kilkoma ciężkimi chorobami współistniejącymi (cukrzyca, otyłość, przewlekła choroba nerek, płuc lub serca itp.), co ma miejsce w przypadku większości osób przyjmowanych na oddziały intensywnej terapii w okresie COVID.

Problemem jest wstrzymanie diagnozy COVID bez rozważenia innych możliwych przyczyn, zwłaszcza w przypadku negatywnego wyniku RT-PCR.

ARDS jest powszechną chorobą od czasu jej odkrycia w 1967 r. (Ashbaugh DG, Bigelow DB, Petty TL, Levine BE, „Acute respiratory distress in adults”, The Lancet, 1967; 2: 319-323).

Stanowi około 10% przyjęć na OIT, a śmiertelność wynosi 40–50%.

Źródło: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5537110/

Jednak wszystkie oddziały intensywnej terapii na świecie rozważają pozytywną diagnozę COVID w przypadku objawów ze strony układu oddechowego (wynik >/= 2) oraz tomografię płucną ARDS (ARDS), nawet jeśli PCR jest ujemny i pomimo braku swoistości objawów i tomografii komputerowej.

W tym szwajcarskim artykule opublikowanym w 2020 roku w Swiss Medical Journal (RMS), lekarze kładą nacisk na ograniczenia tomografu płucnego w diagnostyce COVID19:

„… Jego specyfika jest ograniczona, co naraża go na ryzyko nadrozpoznania. »

Źródło:  https://www.revmed.ch/RMS/2020/RMS-N-692/Utilite-du-CT-scan-thoracique-pour-le-diagnostic-et-le-triage-des-patients-suspects -de-COVID-19

D. PCR lub łańcuchowa reakcja polimerazy

Wymaz z jamy ustnej i gardła lub nosogardzieli z analizą PCR jest pierwszym badaniem diagnostycznym zaproponowanym w celu potwierdzenia zakażenia COVID-19 SARS-CoV-2.

Technika biologii molekularnej lub Technika amplifikacji genów (geny kwasu dezoksyrybonukleinowego-DNA lub kwasu rybonukleinowego-RNA).

PCR został opracowany w latach 80. XX wieku przez Kary Mullis, chemika, który w 1993 r. otrzymał Nagrodę Nobla w dziedzinie chemii.

„… Te testy PCR nie mogą wykryć żadnego wirusa”.

Naprawdę to powiedział (https://www.weblyf.com/2020/05/coronavirus-the-truth-about-pcr-test-kit-from-the-inventor-and-other-experts/)

Od 1992 technika PCR może być wykonywana w sposób ciągły, w czasie rzeczywistym, stąd jej nowoczesna nazwa: RT-PCR: reakcja łańcuchowa polimerazy w czasie rzeczywistym.

Technika ta pozwala uwydatnić ślady czegoś niewidocznego gołym okiem lub nawet pod mikroskopem.

    • Technika PCR jest używana głównie w przemyśle lub kryminologii do wyszukiwania śladów DNA.
    • W medycynie, oprócz badań naukowych, zwłaszcza genetyki, ma zastosowanie w medycynie zakaźnej zajmującej się chorobami zakaźnymi.
    • W szczególności PCR może ujawnić zarazki lub mikroorganizmy, które są trudne w hodowli, takie jak niektóre bakterie (Mycoplasma, Chlamydiae, Mycobacterium Tuberculosis) i wirusy.

Jest to technika referencyjna w poszukiwaniu śladów wirusów układu oddechowego (grypy, SARS).

To pojęcie jest ważne.

Diagnoza za pomocą PCR jest wnioskiem, który może być przedmiotem błędnej interpretacji.

SARS-CoV-2 to wirus RNA o 30 000 parach zasad (pz). Nie należy uwydatniać całego jego genomu, a jedynie określone sekwencje.

Genom SARS-CoV-2 jest znany.

Laboratoria używają starterów genowych specyficznych dla SARS-CoV-2.

Aby uzyskać wiarygodny wynik PCR, co najmniej 2-3 geny muszą być użyte jako startery.

3 geny są najlepsze, a technikę należy wykonać dla wszystkich 3 genów.

Jak to działa?

i. Pobieranie próbek komórek z dróg oddechowych osoby.

Pojedyńcze próbki tylko z gardła, nosa lub śliny wykazują niższą czułość wykrywania (większe ryzyko fałszywie ujemnego wyniku).

Stąd pochodzi pierwsze źródło błędu, fałszywie negatywny wynik, źle wykonana próbka.

Pobranie komórek z tylnej części gardła, do których dochodzi się przez nos lub usta, musi być wykonane przez wyspecjalizowany i przeszkolony personel. To może być ofensywne! Ta próbka może spowodować krwawienie, uszkodzenie błony śluzowej gardła (powierzchni) i / lub błony śluzowej nosa, jeśli zostanie podana przez nos.

ii. Analiza za pomocą RT-PCR4

To urządzenie działa jak kserokopiarka / powiększalnik.

Technika ta ma najlepszą czułość (90%) i swoistość (100%), lepszą niż wszystkie inne konwencjonalne testy do wykrywania patogenów (testy antygenowe, hodowle wirusów). Próbki śliny nie spełniają wymagań.

    • Źródło: Profile czasowe obciążenia wirusem w próbkach śliny tylnej części jamy ustnej i gardła oraz odpowiedzi przeciwciał w surowicy podczas zakażenia SARS-CoV-2: obserwacyjne badanie kohortowe. Lancet Infect Dis. Maj 2020; 20 (5): 565-574].

Wykorzystuje kilka cykli wzmocnienia (powiększenia), mnożąc cel przez 2 w każdym cyklu.

    • 1 cykl: cel x 2
    • 2. cykl: cel x 4
    • 3. cykl: cel x 8
    • 4. cykl: cel x 16
    • 5. cykl: cel x 32
    • itp., do 30 – 40 cykli.

Ct lub Cycle Time lub Cycle Threshold definiuje próg cykli, przy których laboratorium uważa test PCR za pozytywny.

  • Im niższy zastosowany próg Ct, tym większe obciążenie wirusowe (tym więcej wirusa w drogach oddechowych osobnika).
  • Im wyższy zastosowany próg Ct, tym niższe obciążenie wirusem (mniej wirusa w drogach oddechowych).

RT-PCR jest bardzo czułym testem i poprzez zwiększenie Ct (do 40, 50 cykli) możemy znaleźć ślady genetyczne wirusów, które nie stanowią infekcji lub zarażenia!
[W takim przypadku mamy do czynienia z fałszywym pozytywnym wynikiem testu]

Znajomość progu Ct używanego przez laboratorium jest zatem niezbędna do prawidłowej interpretacji wyniku RT-PCR!

Żaden test nie mierzy ilości wirusa w próbce! Test RT-PCR jest jakościowy: wynik pozytywny oznacza obecność wirusa, wynik negatywny – brak wirusa.

Konieczne jest uzyskanie wyniku ilościowego, który jako jedyny odzwierciedla rzeczywiste obciążenie wirusowe. To pojęcie ilości, czyli obciążenie wirusowe, można jedynie oszacować pośrednio na podstawie liczby cykli amplifikacji (Ct) użytych do ujawnienia poszukiwanego wirusa.

  • Im niższa wartość Ct zastosowana do wykazania fragmentu wirusa, tym wyższe (wysokie) obciążenie wirusem.
  • Im wyższe Ct użyte do zademonstrowania fragmentu wirusa, tym niższe (niskie) obciążenie wirusem.

Francuskie Narodowe Centrum Referencyjne (CNR) oszacowało, że w ostrej fazie pandemii (marzec-kwiecień 2020 r.), szczyt wydalania wirusa występował na początku objawów (wraz z pojawieniem się kaszlu), a ilość rozsiewanego wirusa była rzędu około 108 (100 milionom) kopii RNA wirusa SARS-CoV-2 na μl, ze zmiennym czasem wydalania w górnych drogach oddechowych (od 5 dni do ponad 5 tygodni).

Ta liczba 108 (100 milionów) kopii / μl odpowiada bardzo niskiemu Ct.

Dzisiaj (wrzesień 2020 r.), przy progu Ct wynoszącym 32 cykle, wykrywa się od 10 do 15 kopii wirusowego RNA SARS-CoV-2 / μl, czyli znacznie mniej.

Przy progu Ct wynoszącym 35 cykli (standardowy próg Ct dla laboratoriów we Francji i dla europejskiego CDC) odpowiada to 1 kopii próbki wirusowego RNA SARS-CoV-2 / μl!

  • Ct 32 odpowiada zdolności wykrycia 10-15 kopii RNA SARS-CoV-2 / μl.
  • Ct 35 odpowiada zdolności wykrycia 1 kopii RNA SARS-CoV-2 / μl

Źródła:

Powyżej progu Ct 35 nie można wyizolować pełnej sekwencji wirusa.

(Dane przekazane przez Hélène Banoun, https://www.researchgate.net/profile/Helene_Banoun

Dr, biolog, farmaceuta. Były pracownik naukowy INSERM. Były stażysta w szpitalach paryskich i współracownik francuskiego biologa Pierre’a Sonigo, specjalisty w dziedzinie biologii molekularnej i wirusologii, https://fr.wikipedia.org/wiki/Pierre_Sonigo )

(UWAGA! –  1 kopia wirusowego RNA / μl odpowiada 1000 kopii wirusowego RNA / ml. Proszę zwrócić uwagę na jednostki użyte przez laboratorium!)

Prawidłowa interpretacja RT-PCR zależy od:

  1. Znajomości progu Ct lub liczby kopii wirusowego RNA / μl, odzwierciedlających obciążenie wirusowe,
  2. Stanu klinicznego osoby badanej.
    • Pierwszy punkt wskazuje na stopień zaraźliwości.
    • Drugi punkt wskazuje na stopień ciężkości choroby.

Sam pozytywny wynik testu RT-PCR nie oznacza absolutnie nic.

Oparcie leczenia na pojedynczym teście, bez korelowania go ze stanem klinicznym pacjenta, naraża na ryzyko nadmiernej diagnozy. (Nadmierna diagnoza to procedura lub wynik zastosowania kryteriów diagnostycznych, które pozwalają stwierdzić, że u pacjenta istnieje choroba, której w rzeczywistości pacjent nie ma.)

Wykonywanie testu RT-PCR na osobach bezobjawowych nie ma zatem sensu i narzuca niepotrzebne koszty społeczeństwu. Skutkiem w przypadku osób bezobjawowych jest nasilenie strachu przed nieobecną chorobą.

To tak jakby poproszono wszystkich o wykonanie elektrokardiogramu, przy braku jakichkolwiek objawów!

Lekarze powinni wymagać znajomości progu Ct używanego do określenia pozytywnego testu PCR (lub liczby kopii wirusowego RNA / μl próbki), aby prawidłowo zinterpretować wynik.

Wszystkie laboratoria powinny używać tych samych standardów, tej samej wartości granicznej Ct, jeśli to możliwe, wartości granicznej Ct </= 30 i wyrazić wynik jako liczbę kopii wirusowego RNA / μl próbki.

WIRUS: Dyfuzja w atmosferze i potrzeba wentylacji przestrzeni

Wirusy układu oddechowego nie są przenoszone pojedynczo (wirion), ale w grupach w postaci większych cząstek:

1. Cząstki G = mikrokropelki tworzące aerozol: 5 do 150 μm

Przenoszenie od osoby zakażonej przez kaszel, kichanie lub rozmowę.

Gęste i bogate w wodę, ciężkie, pozostają w powietrzu przez krótki czas i są rozpraszane tylko na krótkie odległości: <1 m, po czym szybko opadają na ziemię.

Link:

2. Cząstki A = Cząsteczki unoszące się w powietrzu: <5 μm

Niska gęstość i niska zawartość wody, cząsteczki A są lżejsze, pozostają zawieszone w powietrzu i mają większy zasięg.

Linki:

Podsumowanie

SARS-CoV-2 to wirus RNA o długości 125 nm (0,125 μm), zawierający ok. 30 000 par zasad (nukleotydów).

Powoduje chorobę COVID-19 (COronaVIrusDisease-2019).

Jest wyrzucany przez cząsteczki G (aerozole> 5 μm) ciężkie na <1 m oraz przez cząsteczki A (<5 μm) lekkie na duże odległości: warto wentylować zamknięte przestrzenie!

Diagnoza jest przede wszystkim kliniczna:

  • Objawy tworzące punktację kliniczną,
  • Podejrzenie COVID-19, jeśli wynik kliniczny >/= 2
  • Ocena ciężkości COVID-19 na podstawie wskaźnika wczesnego ostrzegania: EWS (Early Warning Signs)
  • Objawy są mało specyficzne i można je znaleźć w każdej chorobie wirusowej (grypa, przeziębienie, SARS), a nawet bakteryjnej.

Diagnoza zakończona skanem TK płuc: obraz ARDS (lub zespołu ostrej niewydolności oddechowej ARDS): obraz TK nie jest specyficzny dla COVID-19!

Diagnostyka za pomocą techniki RT-PCR reakcji łańcuchowej polimerazy w czasie rzeczywistym: badanie jakościowe wyrażone znakiem dodatnim lub ujemnym.

  • Fałszywie negatywne wyniki istnieją od pobrania próbki do ostatniej amplifikacji metodą PCR, ponieważ technika jest złożona i podatna na potencjalne błędy w obsłudze.
  • RT-PCR ujawnia fragmenty (sekwencje genów) wirusa SARS-CoV-2, a nie samego wirusa. Wyszukiwanie to odbywa się przy użyciu starterów, tj. 2 lub (lepiej) 3 znanych genów SARS-CoV-2 [tak aby test „wiedział” czego ma szukać i co ma wzmacniać / namnażać].
  • Aspekt ilościowy (obciążenie wirusowe) określa liczba cykli amplifikacji (Ct = Cycle Time lub Cycle Threshold) użytych jako próg pozytywności.
    • Im niższy próg (Ct), tym wyższe obciążenie wirusem, tym więcej wirusów w próbce, tym osoba jest bardziej chora i / lub bardziej zaraźliwa.
    • Im wyższy próg (Ct), tym niższe obciążenie wirusowe, tym mniej wirusa, tym mniej osoba jest chora i / lub zaraźliwa.
  • Obecnie progi pozytywności (Ct) RT-PCR są zbyt wysokie (>/= 35), wywołując „epidemię” pozytywnych testów, które są fałszywie dodatnie i nic nie znaczą, ani epidemiologicznie, ani z punktu widzenia zdrowia publicznego !
  • Progi dodatnie (Ct) dla RT-PCR powinny być wystandaryzowane dla wszystkich laboratoriów, podawane w wynikach i powinny być poniżej 35 (nawet 30).

TK płuc i RT-PCR z progiem (Ct) >/= 35 wywołują niebezpieczną NADDIAGNOZĘ, gdy osobnik nie jest najpierw oceniany klinicznie, aby sprawdzić, czy  jest chory, co jest jedyną rzeczą, która naprawdę ma znaczenie.

„Aby zinterpretować wynik PCR, istotne jest, aby klinicyści i mikrobiolodzy podzielili się swoimi doświadczeniami, tak aby można było połączyć analityczny i kliniczny poziom interpretacji” – PCR in Microbiology, RMS, 2007

Autor: Dr Pascal Sacré jest lekarzem specjalizującym się w opiece krytycznej (intensywnej terapii), autorem i znanym analitykiem zdrowia publicznego. Jest pracownikiem naukowym Centrum Badań nad Globalizacją

Artykuły dr Pascala Sacré:

Ten wpis został opublikowany w kategorii COVID-19, Medycyna, Polityka. Dodaj zakładkę do bezpośredniego odnośnika.